Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL20A1Q9P218 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL20A1Q9P218 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms