Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CCDC180Q9P1Z9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
CCDC180Q9P1Z9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.8 ms