Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMG20BQ9P0W2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMG20BQ9P0W2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms