Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP4Q9P0V3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP4Q9P0V3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SH3BP4Q9P0V3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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