Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXXC1Q9P0U4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXXC1Q9P0U4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms