Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDE1Q9NZC3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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