Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CWC25Q9NXE8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CWC25Q9NXE8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms