Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATAD3AQ9NVI7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms