Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L1Q9NU39 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms