Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMC4Q9NTJ3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms