Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms