Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SH3GLB2Q9NR46 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms