Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRDM5Q9NQX1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRDM5Q9NQX1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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