Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NLRC4Q9NPP4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms