Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZCCHC17Q9NP64 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms