Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7BQ9NP56 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms