Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMURF2Q9HAU4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms