Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NXF3Q9H4D5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NXF3Q9H4D5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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