Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD4Q9H223 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms