Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC90BQ9GZT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC90BQ9GZT6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms