Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2J2Q9GZM3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms