Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BPESC1Q9GZL8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BPESC1Q9GZL8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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