Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCSER1Q9C0I3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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