Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPEF2Q9C093 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPEF2Q9C093 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms