Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM54Q9BYV2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM54Q9BYV2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms