Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB11FIP5Q9BXF6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms