Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS2Q9BXC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms