Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IFT27Q9BW83 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IFT27Q9BW83 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms