Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIOK1Q9BRS2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIOK1Q9BRS2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms