Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SDF4Q9BRK5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDF4Q9BRK5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms