Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
USB1Q9BQ65 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
USB1Q9BQ65 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms