Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GAL3ST1Q99999 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms