Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3AQ99856 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3AQ99856 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms