Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms