Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTRQ99707 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTRQ99707 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTRQ99707 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTRQ99707 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms