Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MEIS3Q99687 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MEIS3Q99687 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms