Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SCAF11Q99590 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAF11Q99590 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms