Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCLRE1CQ96SD1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms