Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2Q96Q42 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2Q96Q42 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms