Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACAP3Q96P50 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAP3Q96P50 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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