Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CELF6Q96J87 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CELF6Q96J87 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms