Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC51Q96ER9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC51Q96ER9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms