Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSUN4Q96CB9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSUN4Q96CB9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms