Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-CQ95604 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-CQ95604 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms