Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP6NLQ92738 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP6NLQ92738 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms