Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms