Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSH3Q8TE77 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSH3Q8TE77 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms