Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD1Q8NHV4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms