Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms