Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MYRIPQ8NFW9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MYRIPQ8NFW9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms